DrugDiscovery@home

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DrugDiscovery@home

#1 Post by rebirther » 21.04.2009, 15:05

http://boinc.drugdiscoveryathome.com/
DrugDiscovery@Home is a research project that uses Internet-connected computers to model the behavor of lead compounds that could be developed into new medicines. You can participate by downloading and running a free program on your computer.
DrugDiscovery@Home is in an early alpha phase and does not have a formal relationship with academia or the pharmaceutical industry.
Invitation code required!

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Database crash - recovery in progress

#2 Post by rebirther » 07.08.2009, 19:04

http://boinc.drugdiscoveryathome.com/fo ... php?id=103

Mit Hilfe von BOINCstats wird die Datenbank mit dem letzen Stand wiederhergestellt, dies kann eine Weile dauern.

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#3 Post by Cebion » 29.08.2009, 01:23

tja und die müssen wohl immer noch eine Menge zu tun haben,
denn mein Profil (oder auch von anderen) habe ich immer noch nicht wieder :( angeschrieben habe ich Jack schon mal deswegen, aber er weiss auch nicht, was da schief läuft.
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#4 Post by rebirther » 29.08.2009, 07:40

Cebion wrote:tja und die müssen wohl immer noch eine Menge zu tun haben,
denn mein Profil (oder auch von anderen) habe ich immer noch nicht wieder :( angeschrieben habe ich Jack schon mal deswegen, aber er weiss auch nicht, was da schief läuft.
Bei mir hatte es nur 1h gedauert, dann hatte ich wenigstens mein Account wieder.

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#5 Post by Cebion » 29.08.2009, 13:51

ja, schon richtig ... Account und Credits alles da, nur das Bild runterladen im Profil ... das klappt nicht, bei mir.
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#6 Post by odicin » 22.03.2011, 02:32

Seit langer Zeit gibt es dort mal wieder WU's, der Server sagt zwar oft das keine Arbeit da ist, aber der Generator läuft und mit Glück bekommt man dann auch ab und zu welche. Muss man halt manuell öfters mal versuchen...

Gruß Odi

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Change in administration

#7 Post by odicin » 02.02.2013, 11:06

2013-02-02: Hi all, For the next couple of months I'll be taking over administrating this project. Having neigh on no experience with the BOINC back-end, I'm looking forward to it, if only for the added experience. As the first thing, I have updated the forum software and merged the forums. Then hacked the database to add the news forum. The script that should've done this didn't work. I am now trying to fix it so the news actually shows on the front page, not just in the 'old news' section. There's no work as of yet. I'm busy trying to figure out how to get a Java application working with the new BOINC wrapper. But for this wrapper to work, we need more up-to-date BOINC server software, so guess what's next on the To-Do list?
Es passiert wieder was...

Gruß Odi

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#8 Post by rebirther » 25.04.2013, 04:58

Aufpassen bei dem Laden des Projektes. Google stuft die Seite als gefährlich ein. da sich auf der Domain ein Trojaner eingenistet hat.

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#9 Post by rebirther » 20.05.2013, 09:59

Back
The forums are back. The fancy front page will take a while.
As far as I saw, it was a virus injection in the Drupal code that the front page uses. It's taken all this time to take it down as it ran on a server I had no access to.

The next thing to do is ask Google to come check our sanity any further. And see what we want to do with the Drupal front page. if anyone has more Drupal knowledge than me, PM me. Of course, if you know how to make a fancy HTML page, your help is also welcome. 19 May 2013, 16:59:06 UTC
Virus was removed too.

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#10 Post by DoctorNow » 22.12.2016, 09:44

Bei DrugDiscovery scheint sich plötzlich wieder was zu tun:
Eine neue App und jede Menge WUtzen (die allerdings recht kurz sind) sind seit diesem Morgen verfügbar!
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#11 Post by Buckey » 22.12.2016, 12:22

Die neue App scheint ziemlich Buggy zu sein. Aktuell habe ich die Windows Versionen dd_short_300_windows_intelx86.exe und dd_short_400_windows_intelx86.exe installiert.
Momentan laufen WU´s für die 3er Version und scheinen auch alle validiert zu werden, wobei die nicht auf der CPU berechnet werden, sondern irgendwo anders. Ähnlich sieht es bei Linux aus. Zu Linux gibt es jetzt um 13.22 Uhr noch keine neuere App.

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#12 Post by DoctorNow » 22.12.2016, 17:53

Ich selbst hab zwar keine buggy WUs erlebt, aber die Meldung im Manager sagt das auch aus:
DrugDiscovery@Home: New server and new tests!
Hello everybody!

We are back with new/old DrugDiscovery@Home server :)

Currently (for next few days) we are testing new applications and wrappers, so application will be UNSTABLE at the moment, and project will require re-join if you like to compute it with us.

Please be patient, we will update you soon with more info about applications and also whole project description.
Bin mir nicht sicher, ob der genannte Rejoin eine erneute Kontoeröffnung meint oder einfach einen Reattach mit dem Client.
Letzteres mußte ich sowieo durchführen, da das Projekt nicht mehr in meinem Manager war. Blöd finde ich, daß auf der kompletten Homepage nirgends Hinweise zu finden sind, mit welcher URL man sich anmelden soll - denn www.drugdiscovery.com geht nicht!
Glücklicherweise trifft die URL des Threadanfangs noch voll ins Schwarze damit und stimmt noch, und mein altes Konto war auch noch da. ;-)
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#13 Post by DoctorNow » 18.02.2017, 18:05

DD hat Badges eingeführt. Die Bilder dafür sind recht groß und man kann sie hier ansehen. Im Kleinformat im Konto oder auch bei uns in der Wiki - ich wollte es nicht zu groß machen - geht da natürlich das ein oder andere Detail verloren...
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#14 Post by DoctorNow » 04.04.2017, 17:39

Das kommt mehr oder weniger überraschend:
DrugDiscovery wird (vorübergehend?) eingestellt.
Den genaueren Grund kann man hier nachlesen.
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#15 Post by odicin » 12.07.2017, 06:38

DrugDiscovery@Home: DrugDiscovery@Home is back
After few months and loads of discussion about future of our project we decide that project will be continued in a bit changed team.

At the moment, before we decide to involve other people in it we will stay with:

Andrey Voronkov as project main scientist.

Vladimir Berishvili - project scientist.

Krzysztof Piszczek - main developer, server administrator.

Krzysztof Faryna - project developer, server administrator.

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#16 Post by Buckey » 17.10.2017, 22:33

Bei DrugDiscovery@home wird gerade die gromacs-GPU App (cuda23) getestet. Ich habe bisher mit meiner GTX750 ti unter Linux x64 2 WU´s mit einer ungefähren Laufzeit von 33700 - 33900 Sekunden fertig gestellt. Die Credits sind sehr unterschiedlich: für die ~33.799 sek WU gab es 8.231.65 und für die 33.919 sek WU gab es 111.764. Das ist schon ein beachtlicher Unterschied und eine ziemliche heftige Vergütung. Runtergerechnet auf die Stunde bei der letzten WU sind das dann ~11.864,54 Credits/h für so eine kleine Grafikkarte.

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#17 Post by odicin » 18.10.2017, 07:44

Meine Tasks unter Windows sind leider alle mit

(unknown error) - exit code 195 (0xc3)

abgebrochen.

Gruß Odi

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#18 Post by DoctorNow » 18.10.2017, 09:55

Buckey wrote:Bei DrugDiscovery@home wird gerade die gromacs-GPU App (cuda23) getestet. ...
Also hier liegt m.E. noch einiges im Argen.
Meine Analyse der App zeigte eine sehr schwache GPU-Nutzung, selten über 50% - und ein ganzer CPU-Kern ist sowieso ständig mit der App beschäftigt. Entweder ist sie nicht besonders gut optimiert oder das ganze geht vom Zweck her auch nicht besser. Also aus meiner Sicht ist das bis jetzt noch keine richtige GPU-App... aber vielleicht gibt's da noch Verbesserungen, mal sehen.
Bei den Credits tipp ich auf CreditNew - bei 'nem Quorum von 1 weiß das System erstmal nicht, wie es das Ergebnis bewerten soll. Das wird sich vermutlich noch einpendeln - jede weitere WU, die ich bis jetzt abgeliefert hab, hat jedesmal weniger gebracht.
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#19 Post by Buckey » 18.10.2017, 15:21

Hi Doc,
hast Du die WU unter Linux zum Laufen bekommen oder unter Windows ?
Ich musste mir die Gromacs-App von der Original-Website laden und dann ging es unter Linux.
Das mit dem ganzen CPU-Kern kann ich bestätigen.

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#20 Post by DoctorNow » 18.10.2017, 17:06

Ist die Windoze-Version.
Unter Linux (ich betreib openSuse in der VirtualBox) hab ich leider noch nie eine GraKa zum Laufen bekommen, warum auch immer. Ist andererseits aber auch noch nie nötig gewesen, Linux läuft bei mir nur im Notfall, wenn es keine Win-Apps gibt. ;-)
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